Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CiitaP79621 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CiitaP79621 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms