Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms