Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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