Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps5P59438 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms