Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms