Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CtdsplP58465 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CtdsplP58465 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms