Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms