Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Aqp4P55088 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms