Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rad23aP54726 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms