Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PctpP53808 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms