Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2e3P52483 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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