Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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