Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl11P48298 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms