Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VdrP48281 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VdrP48281 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms