Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms