Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TtlP38585 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtlP38585 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtlP38585 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TtlP38585 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TtlP38585 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtlP38585 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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