Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc5P35689 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc5P35689 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms