Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms