Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms