Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cd28P31041 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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