Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnd1P30999 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnnd1P30999 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnnd1P30999 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnnd1P30999 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnnd1P30999 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms