Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp3P28862 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp3P28862 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp3P28862 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp3P28862 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mmp3P28862 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp3P28862 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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