Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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