Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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