Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RxraP28700 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms