Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms