Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms