Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms