Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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