Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cxcl9P18340 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cxcl9P18340 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cxcl9P18340 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cxcl9P18340 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl9P18340 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl9P18340 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms