Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms