Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P10404 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P10404 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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