Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprqP0C5E4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms