Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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