Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms