Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P01747 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01747 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01747 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms