Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01734 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01734 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01734 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01734 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01734 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01734 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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P01734 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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P01734 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01734 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01734 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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