Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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