Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClppO88696 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClppO88696 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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