Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp2O88554 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms