Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms