Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cited2O35740 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms