Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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