Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms