Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms