Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ArxO35085 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ArxO35085 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ArxO35085 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ArxO35085 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms