Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LhbO09108 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LhbO09108 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LhbO09108 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LhbO09108 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms