Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EllO08856 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms