Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms