Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms